Herhangi bir resmi PCX olarak dönüştürün

Sınırsız dönüştürme. Dosya boyutları 2.5GB'a kadar. Ücretsiz, ömür boyu.

Tüm yerel

Dönüştürücümüz tarayıcınızda çalıştığından, verilerinizi asla görmeyiz.

Çok hızlı

Dosyalarınızı sunucuya yüklemeden anında dönüştürme başlar.

Varsayılan olarak güvenli

Diğer dönüştürücülerin aksine, dosyalarınız bize asla yüklenmez.

PCX formatı nedir?

ZSoft IBM PC Paintbrush

PDB (Protein Veri Bankası) resim formatı, JPEG veya PNG gibi geleneksel bir "resim" formatı değil, proteinler, nükleik asitler ve karmaşık yapılar hakkında üç boyutlu yapısal bilgileri depolayan bir veri formatıdır. PDB formatı, bilim insanlarının biyolojik makromoleküllerin moleküler yapılarını görselleştirmelerine, paylaşmalarına ve analiz etmelerine olanak tanıdığı için biyoinformatik ve yapısal biyolojinin temel taşıdır. PDB arşivi, PDB verilerinin küresel topluluk tarafından özgürce ve herkese açık bir şekilde erişilebilir olmasını sağlayan Dünya Çapında Protein Veri Bankası (wwPDB) tarafından yönetilmektedir.

PDB formatı, moleküler yapıları temsil etmek için standartlaştırılmış bir yönteme olan artan ihtiyacı karşılamak üzere ilk olarak 1970'lerin başında geliştirilmiştir. O zamandan beri, çok çeşitli moleküler verileri barındıracak şekilde evrimleşmiştir. Format metin tabanlıdır ve insanlar tarafından okunabilir ve bilgisayarlar tarafından işlenebilir. Her biri, bu kayıtta bulunan bilgi türünü belirten altı karakterli bir satır tanımlayıcıyla başlayan bir dizi kayıttan oluşur. Kayıtlar, atomik koordinatlar, bağlantı ve deneysel veriler dahil olmak üzere yapının ayrıntılı bir tanımını sağlar.

Tipik bir PDB dosyası, protein veya nükleik asit yapısı hakkında meta veriler içeren bir başlık bölümüyle başlar. Bu bölüm, yapının kısa bir tanımını veren TITLE; kimyasal bileşenleri listeleyen COMPND; ve biyolojik molekülün kökenini tanımlayan SOURCE gibi kayıtları içerir. Başlık ayrıca yapıyı belirleyen kişilerin isimlerini listeleyen AUTHOR kaydını ve yapının ilk kez tanımlandığı literatüre bir atıf sağlayan JOURNAL kaydını da içerir.

Başlığın ardından PDB dosyası, SEQRES kayıtlarında makromolekülün birincil dizi bilgilerini içerir. Bu kayıtlar, zincirde göründükleri şekilde kalıntıların (proteinler için amino asitler, nükleik asitler için nükleotidler) dizisini listeler. Bu bilgi, bir molekülün dizisi ile üç boyutlu yapısı arasındaki ilişkiyi anlamak için çok önemlidir.

ATOM kayıtları, moleküldeki her bir atom için koordinatları içerdikleri için tartışmasız bir PDB dosyasının en önemli parçasıdır. Her ATOM kaydı, atom seri numarası, atom adı, kalıntı adı, zincir tanımlayıcısı, kalıntı dizi numarası ve angstrom cinsinden atomun x, y ve z Kartezyen koordinatlarını içerir. ATOM kayıtları, PyMOL, Chimera veya VMD gibi özel yazılımlar kullanılarak görselleştirilebilen molekülün üç boyutlu yapısının yeniden yapılandırılmasına olanak tanır.

ATOM kayıtlarına ek olarak, metal iyonları, su molekülleri veya proteine veya nükleik aside bağlı diğer küçük moleküller gibi standart olmayan kalıntıların veya ligandların bir parçası olan atomlar için HETATM kayıtları vardır. Bu kayıtlar ATOM kayıtlarına benzer şekilde biçimlendirilir ancak yapı içindeki makromoleküler olmayan bileşenlerin tanımlanmasını kolaylaştırmak için ayırt edilir.

Bağlantı bilgileri, atomlar arasındaki bağları listeleyen CONECT kayıtlarında sağlanır. Bu kayıtlar zorunlu değildir, çünkü çoğu moleküler görselleştirme ve analiz yazılımı atomlar arasındaki mesafelere dayanarak bağlantıyı çıkarabilir. Bununla birlikte, alışılmadık bağları tanımlamak veya bağlanma yalnızca atomik koordinatlardan belirgin olmayabilecek metal koordinasyon komplekslerine sahip yapılar için çok önemlidir.

PDB formatı ayrıca alfa sarmal ve beta tabakaları gibi ikincil yapı elemanlarını belirtmek için kayıtlar içerir. HELIX ve SHEET kayıtları bu yapıları tanımlar ve dizideki konumları hakkında bilgi sağlar. Bu bilgi, makromolekülün katlanma modellerini anlamada yardımcı olur ve karşılaştırmalı çalışmalar ve modelleme için çok önemlidir.

Yapıyı belirlemek için kullanılan deneysel veriler ve yöntemler de PDB dosyasında belgelenmiştir. EXPDTA gibi kayıtlar deneysel tekniği (örneğin, X-ışını kristalografisi, NMR spektroskopisi) tanımlarken, REMARK kayıtları veri toplama, çözünürlük ve iyileştirme istatistikleri hakkında ayrıntılar dahil olmak üzere yapı hakkında çok çeşitli yorumlar ve açıklamalar içerebilir.

END kaydı, PDB dosyasının sonunu belirtir. PDB formatının yaygın olarak kullanılmasına rağmen, yaşı ve sabit sütun genişliği formatı nedeniyle bazı sınırlamaları olduğunu belirtmek önemlidir; bu, çok sayıda atoma sahip veya daha fazla hassasiyet gerektiren modern yapılarla ilgili sorunlara yol açabilir. Bu sınırlamaları gidermek için mmCIF (makromoleküler Kristalografik Bilgi Dosyası) adlı güncellenmiş bir format geliştirilmiştir; bu format, makromoleküler yapıları temsil etmek için daha esnek ve genişletilebilir bir çerçeve sunar.

mmCIF formatının geliştirilmesine rağmen, PDB formatı basitliği ve onu destekleyen çok sayıda yazılım aracı nedeniyle popülerliğini korumaktadır. Araştırmacılar, ihtiyaçlarına ve kullandıkları araçlara bağlı olarak PDB ve mmCIF formatları arasında sıklıkla dönüşüm yaparlar. PDB formatının uzun ömürlülüğü, yapısal biyoloji alanındaki temel rolünün ve karmaşık yapısal bilgileri nispeten basit bir şekilde iletmedeki etkinliğinin bir kanıtıdır.

PDB dosyalarıyla çalışmak için bilim insanları çeşitli hesaplama araçları kullanırlar. Moleküler görselleştirme yazılımı, kullanıcıların PDB dosyalarını yüklemelerine ve yapıları üç boyutlu olarak görüntülemelerine, döndürmelerine, yakınlaştırıp uzaklaştırıp atomların uzamsal düzenini daha iyi anlamak için farklı işleme stilleri uygulamalarına olanak tanır. Bu araçlar genellikle mesafeleri, açıları ve dihedral açıları ölçme, moleküler dinamikleri simüle etme ve yapı içindeki veya potansiyel ligandlarla etkileşimleri analiz etme gibi ek işlevler sağlar.

PDB formatı, hesaplamalı biyoloji ve ilaç keşfinde de çok önemli bir rol oynar. PDB dosyalarından elde edilen yapısal bilgiler, ilgili bir proteinin bilinen yapısının, ilgilendiğimiz bir proteinin yapısını tahmin etmek için kullanıldığı homologi modellemesinde kullanılır. Yapıya dayalı ilaç tasarımında, hedef proteinlerin PDB dosyaları, daha sonra laboratuvarda sentezlenip test edilebilecek potansiyel ilaç bileşiklerini taramak ve optimize etmek için kullanılır.

PDB formatının etkisi, bireysel araştırma projelerinin ötesine geçer. Protein Veri Bankası'nın kendisi, şu anda 150.000'den fazla yapı içeren bir havuzdur ve yeni yapılar belirlenip depolandıkça büyümeye devam etmektedir. Bu veritabanı, öğrencilerin biyolojik makromoleküllerin yapılarını keşfetmelerine ve öğrenmelerine olanak tanıyarak eğitim için çok değerli bir kaynaktır. Ayrıca, son on yıllarda yapısal biyolojideki ilerlemenin tarihi bir kaydı olarak da hizmet eder.

Sonuç olarak, PDB resim formatı, biyolojik makromoleküllerin üç boyutlu yapılarını depolamak, paylaşmak ve analiz etmek için bir araç sağlayan yapısal biyoloji alanında kritik bir araçtır. Bazı sınırlamaları olsa da, yaygın olarak benimsenmesi ve kullanımı için zengin bir araç ekosisteminin geliştirilmesi, öngörülebilir gelecekte önemli bir format olmaya devam edeceğini garanti etmektedir. Yapısal biyoloji alanı gelişmeye devam ettikçe, PDB formatı muhtemelen mmCIF gibi daha gelişmiş formatlarla desteklenecektir, ancak mirası, modern yapısal biyolojinin üzerine inşa edildiği temel olarak kalacaktır.

Desteklenen formatlar

AAI.aai

AAI Dune resmi

AI.ai

Adobe Illustrator CS2

AVIF.avif

AV1 Resim Dosya Biçimi

AVS.avs

AVS X resmi

BAYER.bayer

Ham Bayer Resmi

BMP.bmp

Microsoft Windows bitmap resmi

CIN.cin

Cineon Resim Dosyası

CLIP.clip

Resim Clip Maskesi

CMYK.cmyk

Ham siyan, magenta, sarı ve siyah örnekleri

CMYKA.cmyka

Ham siyan, magenta, sarı, siyah ve alfa örnekleri

CUR.cur

Microsoft simgesi

DCX.dcx

ZSoft IBM PC çok sayfalı Paintbrush

DDS.dds

Microsoft DirectDraw Yüzeyi

DPX.dpx

SMTPE 268M-2003 (DPX 2.0) resmi

DXT1.dxt1

Microsoft DirectDraw Yüzeyi

EPDF.epdf

Encapsulated Portable Document Format

EPI.epi

Adobe Encapsulated PostScript Interchange biçimi

EPS.eps

Adobe Encapsulated PostScript

EPSF.epsf

Adobe Encapsulated PostScript

EPSI.epsi

Adobe Encapsulated PostScript Interchange biçimi

EPT.ept

TIFF önizlemeli Encapsulated PostScript

EPT2.ept2

TIFF önizlemeli Encapsulated PostScript Level II

EXR.exr

Yüksek dinamik aralıklı (HDR) resim

FARBFELD.ff

Farbfeld

FF.ff

Farbfeld

FITS.fits

Esnek Resim Taşıma Sistemi

GIF.gif

CompuServe grafik değişim biçimi

GIF87.gif87

CompuServe grafik değişim biçimi (sürüm 87a)

GROUP4.group4

Ham CCITT Group4

HDR.hdr

Yüksek Dinamik Aralıklı resim

HRZ.hrz

Yavaş Tarama Televizyonu

ICO.ico

Microsoft simgesi

ICON.icon

Microsoft simgesi

IPL.ipl

IP2 Konum Resmi

J2C.j2c

JPEG-2000 kod akışı

J2K.j2k

JPEG-2000 kod akışı

JNG.jng

JPEG Ağ Grafikleri

JP2.jp2

JPEG-2000 Dosya Biçimi Sözdizimi

JPC.jpc

JPEG-2000 kod akışı

JPE.jpe

Joint Photographic Experts Group JFIF biçimi

JPEG.jpeg

Joint Photographic Experts Group JFIF biçimi

JPG.jpg

Joint Photographic Experts Group JFIF biçimi

JPM.jpm

JPEG-2000 Dosya Biçimi Sözdizimi

JPS.jps

Joint Photographic Experts Group JPS biçimi

JPT.jpt

JPEG-2000 Dosya Biçimi Sözdizimi

JXL.jxl

JPEG XL resmi

MAP.map

Çok çözünürlüklü Dikişsiz Resim Veritabanı (MrSID)

MAT.mat

MATLAB seviye 5 resim biçimi

PAL.pal

Palm pixmap

PALM.palm

Palm pixmap

PAM.pam

Ortak 2-boyutlu bitmap formatı

PBM.pbm

Taşınabilir bitmap formatı (siyah ve beyaz)

PCD.pcd

Fotoğraf CD

PCDS.pcds

Fotoğraf CD

PCT.pct

Apple Macintosh QuickDraw/PICT

PCX.pcx

ZSoft IBM PC Paintbrush

PDB.pdb

Palm Veritabanı ImageViewer Formatı

PDF.pdf

Taşınabilir Belge Formatı

PDFA.pdfa

Taşınabilir Belge Arşiv Formatı

PFM.pfm

Taşınabilir float formatı

PGM.pgm

Taşınabilir gri tonlama formatı (gri ölçek)

PGX.pgx

JPEG 2000 sıkıştırılmamış formatı

PICON.picon

Kişisel Simgesi

PICT.pict

Apple Macintosh QuickDraw/PICT

PJPEG.pjpeg

Joint Photographic Experts Group JFIF formatı

PNG.png

Taşınabilir Ağ Grafikleri

PNG00.png00

PNG orijinal görüntüden bit derinliği, renk tipi devralan

PNG24.png24

Opak veya ikili saydam 24-bit RGB (zlib 1.2.11)

PNG32.png32

Opak veya ikili saydam 32-bit RGBA

PNG48.png48

Opak veya ikili saydam 48-bit RGB

PNG64.png64

Opak veya ikili saydam 64-bit RGBA

PNG8.png8

Opak veya ikili saydam 8-bit dizinli

PNM.pnm

Taşınabilir herhangi bir harita

PPM.ppm

Taşınabilir pixmap formatı (renk)

PS.ps

Adobe PostScript dosyası

PSB.psb

Adobe Büyük Belge Formatı

PSD.psd

Adobe Photoshop bitmap

RGB.rgb

Ham kırmızı, yeşil ve mavi örnekleri

RGBA.rgba

Ham kırmızı, yeşil, mavi ve alfa örnekleri

RGBO.rgbo

Ham kırmızı, yeşil, mavi ve opaklık örnekleri

SIX.six

DEC SIXEL Grafik Formatı

SUN.sun

Sun Rasterfile

SVG.svg

Ölçeklenebilir Vektör Grafikleri

SVGZ.svgz

Sıkıştırılmış Ölçeklenebilir Vektör Grafikleri

TIFF.tiff

Etiketli Görüntü Dosya Formatı

VDA.vda

Truevision Targa görüntüsü

VIPS.vips

VIPS görüntüsü

WBMP.wbmp

Kablosuz Bitmap (seviye 0) görüntüsü

WEBP.webp

WebP Görüntü Formatı

YUV.yuv

CCIR 601 4:1:1 veya 4:2:2

Sıkça sorulan sorular

Bu nasıl çalışır?

Bu dönüştürücü tamamen tarayıcınızda çalışır. Bir dosya seçtiğinizde, belleğe okunur ve seçilen formata dönüştürülür. Daha sonra dönüştürülmüş dosyayı indirebilirsiniz.

Bir dosyanın dönüştürülmesi ne kadar sürer?

Dönüştürmeler anında başlar ve çoğu dosya bir saniyenin altında dönüştürülür. Daha büyük dosyalar daha uzun sürebilir.

Dosyalarım ne olur?

Dosyalarınız hiçbir zaman sunucularımıza yüklenmez. Tarayıcınızda dönüştürülür ve dönüştürülmüş dosya daha sonra indirilir. Dosyalarınızı asla görmeyiz.

Hangi dosya türlerini dönüştürebilirim?

Tüm görüntü formatları arasında dönüştürme destekliyoruz, bunlar arasında JPEG, PNG, GIF, WebP, SVG, BMP, TIFF ve daha fazlası bulunuyor.

Bunun maliyeti ne kadar?

Bu dönüştürücü tamamen ücretsizdir ve her zaman ücretsiz kalacaktır. Tarayıcınızda çalıştığı için sunucular için ödeme yapmamıza gerek yok, bu yüzden size ücret talep etmiyoruz.

Aynı anda birden fazla dosya dönüştürebilir miyim?

Evet! İstediğiniz kadar dosyayı aynı anda dönüştürebilirsiniz. Sadece eklerken birden fazla dosya seçin.