Xóa nền tách một đối tượng khỏi môi trường xung quanh để bạn có thể đặt nó trên nền trong suốt, hoán đổi cảnh hoặc ghép nó vào một thiết kế mới. Về cơ bản, bạn đang ước tính một mặt n ạ alpha—độ mờ mỗi pixel từ 0 đến 1—và sau đó ghép alpha tiền cảnh lên một thứ khác. Đây là toán học từ Porter–Duff và là nguyên nhân của các cạm bẫy quen thuộc như “viền” và alpha thẳng và alpha nhân trước. Để có hướng dẫn thực tế về nhân trước và màu tuyến tính, hãy xem ghi chú Win2D của Microsoft, Søren Sandmann, và bài viết của Lomont về trộn tuyến tính.
Nếu bạn có thể kiểm soát việc chụp, hãy sơn phông nền bằng một màu đồng nhất (thường là màu xanh lá cây) và loại bỏ màu đó. Nó nhanh, đã được thử nghiệm trong phim và phát sóng, và lý tưởng cho video. Sự đánh đổi là ánh sáng và trang phục: ánh sáng màu tràn ra các cạnh (đặc biệt là tóc), vì vậy bạn sẽ sử dụng các công cụ khử tràn để trung hòa ô nhiễm. Các tài liệu tham khảo tốt bao gồm tài liệu của Nuke, Mixing Light, và một bản demo thực hành Fusion.
Đối với các hình ảnh đơn lẻ có nền lộn xộn, các thuật toán tương tác cần một vài gợi ý của người dùng—ví dụ: một hình chữ nhật lỏng lẻo hoặc các nét vẽ nguệch ngoạc—và hội tụ thành một mặt nạ sắc nét. Phương pháp kinh điển là GrabCut (chương sách), học các mô hình màu cho tiền cảnh/nền và sử dụng các đường cắt đồ thị lặp đi lặp lại để tách chúng. Bạn sẽ thấy những ý tưởng tương tự trong Lựa chọn tiền cảnh của GIMP dựa trên SIOX (plugin ImageJ).
Matting giải quyết độ trong suốt phân đoạn ở các ranh giới mỏng manh (tóc, lông, khói, kính). Matting dạng đóng cổ điển lấy một bản đồ ba vùng (chắc chắn-tiền cảnh/chắc chắn-nền/không xác định) và giải một hệ thống tuyến tính cho alpha với độ trung thực cạnh mạnh. Matting hình ảnh sâu hiện đại đào tạo các mạng nơ-ron trên bộ dữ liệu Adobe Composition-1K (tài liệu MMEditing), và được đánh giá bằng các số liệu như SAD, MSE, Gradient và Connectivity (giải thích điểm chuẩn).
Công việc phân đoạn liên quan cũng hữu ích: DeepLabv3+ tinh chỉnh các ranh giới bằng một bộ mã hóa-giải mã và các tích chập atrous (PDF); Mask R-CNN cung cấp các mặt nạ cho mỗi phiên bản (PDF); và SAM (Segment Anything) là một mô hình nền tảng có thể nhắc tạo ra các mặt nạ không cần học trên các hình ảnh không quen thuộc.
Công trình học thuật báo cáo các lỗi SAD, MSE, Gradient, và Connectivity trên Composition-1K. Nếu bạn đang chọn một mô hình, hãy tìm những số liệu đó (định nghĩa số liệu; phần số liệu của Background Matting). Đối với chân dung/video, MODNet và Background Matting V2 rất mạnh; đối với các hình ảnh “đối tượng nổi bật” chung, U2-Net là một đường cơ sở vững chắc; đối với độ trong suốt khó, FBA có thể sạch hơn.
PDB (Protein Data Bank) ảnh định dạng không phải là một định dạng 'ảnh' truyền thống như JPEG hoặc PNG, mà là một định dạng dữ liệu lưu trữ thông tin cấu trúc ba chiều về protein, axit nucleic và các tập hợp phức tạp. Định dạng PDB là nền tảng của tin sinh học và sinh học cấu trúc, vì nó cho phép các nhà khoa học hình dung, chia sẻ và phân tích các cấu trúc phân tử của các đại phân tử sinh học. Kho lưu trữ PDB được quản lý bởi Ngân hàng dữ liệu protein toàn cầu (wwPDB), đảm bảo rằng dữ liệu PDB được cung cấp miễn phí và công khai cho cộng đồng toàn cầu.
Định dạng PDB lần đầu tiên được phát triển vào đầu những năm 1970 để phục vụ nhu cầu ngày càng tăng về một phương pháp chuẩn hóa để biểu diễn các cấu trúc phân tử. Kể từ đó, nó đã phát triển để chứa nhiều loại dữ liệu phân tử. Định dạng này dựa trên văn bản và có thể được con người đọc cũng như được máy tính xử lý. Nó bao gồm một loạt các bản ghi, mỗi bản ghi bắt đầu bằng một mã định danh dòng gồm sáu ký tự chỉ định loại thông tin có trong bản ghi đó. Các bản ghi cung cấp mô tả chi tiết về cấu trúc, bao gồm tọa độ nguyên tử, kết nối và dữ liệu thực nghiệm.
Một tệp PDB điển hình bắt đầu bằng phần tiêu đề, bao gồm siêu dữ liệu về cấu trúc protein hoặc axit nucleic. Phần này chứa các bản ghi như TITLE, cung cấp mô tả ngắn gọn về cấu trúc; COMPND, liệt kê các thành phần hóa học; và SOURCE, mô tả nguồn gốc của phân tử sinh học. Tiêu đề cũng bao gồm bản ghi AUTHOR, liệt kê tên của những người xác định cấu trúc và bản ghi JOURNAL, cung cấp trích dẫn cho tài liệu nơi cấu trúc được mô tả lần đầu tiên.
Tiếp theo tiêu đề, tệp PDB chứa thông tin trình tự chính của đại phân tử trong các bản ghi SEQRES. Các bản ghi này liệt kê trình tự các phần tử còn lại (axit amin đối với protein, nucleotide đối với axit nucleic) khi chúng xuất hiện trong chuỗi. Thông tin này rất quan trọng để hiểu mối quan hệ giữa trình tự của một phân tử và cấu trúc ba chiều của nó.
Các bản ghi ATOM được cho là phần quan trọng nhất của tệp PDB, vì chúng chứa tọa độ cho từng nguyên tử trong phân tử. Mỗi bản ghi ATOM bao gồm số sê-ri nguyên tử, tên nguyên tử, tên phần tử còn lại, mã định danh chuỗi, số trình tự phần tử còn lại và tọa độ Descartes x, y và z của nguyên tử tính bằng angstrom. Các bản ghi ATOM cho phép tái tạo cấu trúc ba chiều của phân tử, có thể được hình dung bằng phần mềm chuyên dụng như PyMOL, Chimera hoặc VMD.
Ngoài các bản ghi ATOM, còn có các bản ghi HETATM cho các nguyên tử là một phần của các phần tử còn lại hoặc phối tử không chuẩn, chẳng hạn như ion kim loại, phân tử nước hoặc các phân tử nhỏ khác liên kết với protein hoặc axit nucleic. Các bản ghi này được định dạng tương tự như các bản ghi ATOM nhưng được phân biệt để tạo điều kiện xác định các thành phần không ph ải đại phân tử trong cấu trúc.
Thông tin kết nối được cung cấp trong các bản ghi CONECT, liệt kê các liên kết giữa các nguyên tử. Các bản ghi này không bắt buộc, vì hầu hết các phần mềm phân tích và hình dung phân tử có thể suy ra kết nối dựa trên khoảng cách giữa các nguyên tử. Tuy nhiên, chúng rất quan trọng để xác định các liên kết bất thường hoặc đối với các cấu trúc có phức hợp phối hợp kim loại, trong đó liên kết có thể không rõ ràng chỉ từ tọa độ nguyên tử.
Định dạng PDB cũng bao gồm các bản ghi để chỉ định các phần tử cấu trúc thứ cấp, chẳng hạn như xoắn alpha và tấm beta. Các bản ghi HELIX và SHEET xác định các cấu trúc này và cung cấp thông tin về vị trí của chúng trong trình tự. Thông tin này giúp hiểu các mẫu gấp của đại phân tử và rất cần thiết cho các nghiên cứu so sánh và mô hình hóa.
Dữ liệu thực nghiệm và các phương pháp được sử dụng để xác định cấu trúc cũng được ghi lại trong tệp PDB. Các bản ghi như EXPDTA mô tả kỹ thuật thực nghiệm (ví dụ: tinh thể học tia X, phổ NMR), trong khi các bản ghi REMARK có thể chứa nhiều loại bình luận và chú thích về cấu trúc, bao gồm các chi tiết về thu thập dữ liệu, độ phân giải và số liệu thống kê tinh chỉnh.
Bản ghi END biểu thị phần cuối của tệp PDB. Điều quan trọng cần lưu ý là mặc dù định dạng PDB được sử dụng rộng rãi, nhưng nó có một số hạn chế do tuổi của nó và định dạng chiều rộng cột cố định, có thể dẫn đến các vấn đề với các cấu trúc hiện đại có nhiều nguyên tử hoặc yêu cầu độ chính xác cao hơn. Để giải quyết những hạn chế này, một định dạng được cập nhật có tên là mmCIF (Tệp thông tin tinh thể học đại phân tử) đã được phát triển, cung cấp một khuôn khổ linh hoạt và mở rộng hơn để biểu diễn các cấu trúc đại phân tử.
Mặc dù định dạng mmCIF được phát triển, nhưng định dạng PDB vẫn phổ biến do tính đơn giản và số lượng lớn các công cụ phần mềm hỗ trợ nó. Các nhà nghiên cứu thường chuyển đổi giữa các định dạng PDB và mmCIF tùy thuộc vào nhu cầu của họ và các công cụ họ đang sử dụng. Tuổi thọ của định dạng PDB là minh chứng cho vai trò cơ bản của nó trong lĩnh vực sinh học cấu trúc và hiệu quả của nó trong việc truyền đạt thông tin cấu trúc phức tạp theo cách tương đối đơn giản.
Để làm việc với các tệp PDB, các nhà khoa học sử dụng nhiều công cụ tính toán. Phần mềm hình dung phân tử cho phép người dùng tải các tệp PDB và xem các cấu trúc ở ba chiều, xoay chúng, phóng to và thu nhỏ và áp dụng các kiểu kết xuất khác nhau để hiểu rõ hơn về sự sắp xếp không gian của các nguyên tử. Các công cụ này thường cung cấp các chức năng bổ sung, chẳng hạn như đo khoảng cách, góc và dihedral, mô phỏng động lực học phân tử và phân tích các tương tác trong cấu trúc hoặc với các phối tử tiềm năng.
Định dạng PDB cũng đóng một vai trò quan trọng trong sinh học tính toán và khám phá thuốc. Thông tin cấu trúc từ các tệp PDB được sử dụng trong mô hình đồng đẳng, trong đó cấu trúc đã biết của một protein liên quan được sử dụng để dự đoán cấu trúc của một protein quan tâm. Trong thiết kế thuốc dựa trên cấu trúc, các tệp PDB của protein mục tiêu được sử dụng để sàng lọc và tối ưu hóa các hợp chất thuốc tiềm năng, sau đó có thể được tổng hợp và thử nghiệm trong phòng thí nghiệm.
Tác động của định dạng PDB vượt ra ngoài các dự án nghiên cứu riêng lẻ. Bản thân Ngân hàng dữ liệu protein là một kho lưu trữ hiện chứa hơn 150.000 cấu trúc và nó tiếp tục phát triển khi các cấu trúc mới được xác định và gửi. Cơ sở dữ liệu này là một nguồn tài nguyên vô giá cho giáo dục, cho phép sinh viên khám phá và tìm hiểu về cấu trúc của các đại phân tử sinh học. Nó cũng đóng vai trò như một hồ sơ lịch sử về tiến trình của sinh học cấu trúc trong những thập kỷ qua.
Tóm lại, định dạng hình ảnh PDB là một công cụ quan trọng trong lĩnh vực sinh học cấu trúc, cung cấp phương tiện để lưu trữ, chia sẻ và phân tích các cấu trúc ba chiều của các đại phân tử sinh học. Mặc dù có một số hạn chế, nhưng việc áp dụng rộng rãi và sự phát triển của một hệ sinh thái phong phú các công cụ để sử dụng nó đảm bảo rằng nó sẽ vẫn là một định dạng chính trong tương lai gần. Khi lĩnh vực sinh học cấu trúc tiếp tục phát triển, định dạng PDB có thể sẽ được bổ sung bởi các định dạng tiên tiến hơn như mmCIF, nhưng di sản của nó sẽ tồn tại như nền tảng mà sinh học cấu trúc hiện đại được xây dựng.
Bộ chuyển đổi này chạy hoàn toàn trong trình duyệt của bạn. Khi bạn chọn một tệp, nó sẽ được đọc vào bộ nhớ và chuyển đổi sang định dạng đã chọn. Sau đó, bạn có thể tải xuống tệp đã chuyển đổi.
Việc chuyển đổi bắt đầu ngay lập tức và hầu hết các tệp được chuyển đổi trong vòng chưa đầy một giây. Các tệp lớn hơn có thể mất nhiều thời gian hơn.
Các tệp của bạn không bao giờ được tải lên máy chủ của chúng tôi. Chúng được chuyển đ ổi trong trình duyệt của bạn và sau đó tệp đã chuyển đổi sẽ được tải xuống. Chúng tôi không bao giờ thấy các tệp của bạn.
Chúng tôi hỗ trợ chuyển đổi giữa tất cả các định dạng hình ảnh, bao gồm JPEG, PNG, GIF, WebP, SVG, BMP, TIFF, v.v.
Bộ chuyển đổi này hoàn toàn miễn phí và sẽ luôn miễn phí. Bởi vì nó chạy trong trình duyệt của bạn, chúng tôi không phải trả tiền cho máy chủ, vì vậy chúng tôi không cần tính phí bạn.
Đúng! Bạn có thể chuyển đổi bao nhiêu tệp tùy thích cùng một lúc. Chỉ cần chọn nhiều tệp khi bạn thêm chúng.